L’autogestion c’est la gestion d’une structure par celles et ceux qui y participent concrètement, dans une perspective d’égalité, de fédéralisme et d’absence de hiérarchie. Cette autogestion, la CNT la revendique pour un changement global de société : la gestion des entreprises par celles et ceux qui y travaillent, une société sans État ni Patron. Elle la pratique également au quotidien dans ses différentes activités syndicales et à tous les niveaux.

À l’intérieur des structures syndicales :
 en refusant les permanentEs pour éviter la bureaucratisation et maintenir l’égalité entre les syndiquéEs. L’ensemble des activités de la CNT repose donc sur des travailleurEUSEs mandatéEs sur des tâches précises et révocables à tout moment.
 en promouvant la rotation des tâches, pour éviter la personnification des activités et une trop grande spécialisation au profit de certainE.
 avec le caractère décisionnel des assemblées générales de syndicat, et le rôle uniquement pratique et fonctionnel du bureau.
 en favorisant l’égale participation de tous et toutes, et leur égale responsabilité vis-à-vis des activités du syndicat.

Dans les luttes :
 en se battant pour que des Assemblées Générales de salarié-e-s en lutte aient lieu, et qu’elles soient souveraines.
 en se battant pour que les déléguéEs des AG soient mandaté-e-s précisément et révocables.
 en refusant les pratiques d’instrumentalisation des luttes au détriment de celles et ceux en lutte.

Puisque personne ne travaille à ta place, que personne ne décide à ta place.